わかりづらくて申し訳ございません。
まず機種変更時のiCloudバックアップについて。これはお使いの端末のiCloudの設定で、その端末自体のバックアップを取る設定になっていれば、アプリ内のデータも一緒にバックアップされています。
これを使うことで機種変更のときもアプリ内のデータを移行できます。
このアプリの設定画面にある「iCloudバックアップ」機能は、これとは別のもので、アプリ内で、ご自身のiCloudにアプリ内のデータだけ個別にバックアップを作ることができます。
これは手動で自分でバックアップを作るものです。用途としては、こまめに自分でバックアップを作っておきたい方や、iPadなど他の端末とのデータ移行・同期を行いたい方にお使いいただける機能です。
もちろん機種変更のときにもこの機能は使えるので、簡単に移行ができるようになります。
まとめると、機種変更のときは、もともと使えるiCloudバックアップ機能で、何もしなくても無料でデータ移行できます。
これとは別に、念の為バックアップを作成したいという場合には、このアプリの設定画面にある「iCloudバックアップ」機能を使えば、毎回こまめにバックアップが作れるので、突然の端末紛失・故障に備えることができ、気軽にバックアップ・復元がいつでもできます。
よろしくお願いいたします。